En los subsuelos del Centro Cívico hay espacio para 164 vehículos. 99 boxes están habilitados actualmente. 85 son para las reparticiones, de las cuales sólo 30 ocupan los vehículos oficiales, y 14 para movilidades de carga y descarga, discapacitados y de emergencia. Para cuando se inaugure el resto del edificio, se sumarán 65 espacios más que serán destinados a las carteras que se trasladen al establecimiento. Para poder ingresar al estacionamiento de los subsuelos del Centro Cívico se debe presentar una tarjeta magnética personal. En cambio, para dejar un vehículo en el predio de la ex estación se muestra en la entrada una credencial de cartón habilitante que no lleva los datos de quien entra. Para los empleados del Centro Cívico con motos, también hay un lugar en el predio de la ex Estación San Martín. Pero, además, también se habilitó un estacionamiento para estos vehículos sobre la calle Las Heras, frente al Centro Cívico.
